微波主要用于休闲食品的杀菌，如：泡菜类、盐焗类、鱼片、肉干、豆干、五香炸肉等杀菌用。

        微波杀菌原理主要是微波与物料直接相互作用，将超高频电磁波转化为热能的过程。微波杀菌是微波热效应和生物效应共同作用的结果。微波对细菌膜断面的电位分布影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细菌因此营养不良，不能正常新陈代谢，生长发育受阻碍死亡。从生化角度来看，细菌正常生长和繁殖的核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）是由若干氢键紧密连接而成的卷曲大分子，微波导致氢键松弛、断裂和重组，从而诱发遗传基因或染色体畸变，甚至断裂。微波杀菌正是利用电磁场效应和生物效应起到对微生物的杀灭作用。

        采用微波杀菌设备对休闲食品进行杀菌，杀菌温度、杀菌时间、产品品质保持、产品保质期及节能方面，较常规的靠热力杀菌都有明显的优势。

        微波杀菌设备特点：
        1、杀菌温度低。一般杀菌温度在70—80℃。
        2、杀菌时间短。微波杀菌波设备可快速对食品进行杀菌，约5—10分钟就可达到杀菌的效果。
        3、杀菌彻底。由于微波可穿透一定厚度的食品，所以微波在对食品进行杀菌时，可内外同时杀菌。
        4、产品品质好、延迟食品的保质期。
        5、保持食品原有的风味及营养。
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